Klasifikasi protein

Berdasarkan komposisi kimia
Protein dibagi menjadi 2 yaitu:
a.    Protein sederhana: terdiri atas asam amino tanpa gugus kimia lain.
b.    Protein konjugasi: terdiri atas rantai polipeptida yang terikat pada gugus kimia lain.
1.    gugus prostetik: bagian yang bukan asam amino dari protein konjugasi.
2.    protein konjugasi digolongkan berdasarkan jenis gugus prostetiknya.

Berdasarkan bentuk
Protein digolongkan menjadi 2 yaitu:
a.    Protein serabut
Ciri:
1.    serabut panjang
2.    tidak larut dalam air
3.    mempunyai fungsi struktural atau pelindung
contoh:
-    kolagen: jenis protein yang terdapat pada jaringan ikat
-    keratin: jenis protein yang terdapat dalam bulu domba, sutera alam, rambut, kuku, kulit
-    aktin: (interaksi otot)
-    fibrin: pembekuan darah.

b.    Protein globuler
Ciri:
1.    protein yang sangat besar
2.    larut dalam air dan mudah berdifusi
contoh:
-    albumin: terdapat dalam serum darah dan putih telur
-    globulin: terdapat dalam serum darah, otot dan jaringan lain pada tubuh
-    histon: terdapat pada jaringan kelenjar pankreas
-    protamin: terdapat dalam sel sperma ikan
-    enzim, antibodi, hemoglobin, kasein, dan lain-lain.

Berdasarkan fungsi biologi
Protein digolongkan menjadi 7 golongan:
a.    Protein struktur
Fungsi: memberikan struktur biologi kekuatan atau perlindungan
Contoh: kolagen, keratin, fibroin

b.    Protein nutrien dan penyimpan
Fungsi: cadangan makanan
Contoh: ovalbumin pada telur, kasein pada susu

c.    Anti bodi
Fungsi: kekebalan tubuh
Contoh: imunoglobin, fibrinogen, dan trombin

d.    Enzim
Fungsi: biokatalis
Contoh: fibrinogen, amilase

e.    Protein pengatur
Fungsi: pengatur aktifitas seluler
Contoh: hormon

f.    Protein transport
Fungsi: mengikat dan memindahkan molekul atau ion spesifik
Contoh: Hb

g.    Protein kontraktil
Fungsi: memberikan kemampuan makhluk hidup untuk bergerak
Contoh: aktin, miosin.

Berdasarkan gabungan dengan senyawa lain
a.    Muka protein: gabungan protein dengan gugus karbohidrat
b.    Lipoprotein: gabungan protein dengan lemak
c.    Nukleoprotein: gabungan protein dengan asam nukleat.